南京中西醫結合醫院眼科是集醫療、教學、科研為一體的中西醫結合科室。目前已承擔南京市科技局社會發展項目課題一項，南京市衛生局醫學科技發展項目兩項。在研一項，順利結題兩項。已發表中華系列論文4篇，核心期刊論文10余篇。南京中西醫結合醫院開展中醫、西醫、中西醫結合等特色治療外眼、眼表、前節、后節各種疾病，形成了一系列獨特的治療技術。青少年近視綜合防治和弱視治療已形成了一整套成熟的個性化的干預治療流程。配備有先進的裂隙燈顯微鏡、眼科Ａ/Ｂ超、手術顯微鏡、高頻淚道治療儀、各種顯微手術器械、眼部中藥熏蒸治療儀、帶狀光檢影儀、直接眼底鏡、非接觸眼壓計、全自動電腦視野計、視覺電生理檢查儀、全自動電腦驗光儀(日本TOPCOM)、綜合驗光儀、眼前節照相系統、眼底照相系統、角膜地形圖、眼部生物測量儀、光學相干斷層掃描儀（德國ZEISS）等一批先進儀器設備；現常規開展了白內障超聲乳化聯合人工晶體植入術、小切口白內障摘除聯合人工晶體植入術、抗青光眼手術、斜視矯正術、淚道狹窄阻塞的微創治療、眼外傷的手術治療、羊膜移植治療酸、堿燒傷、復發性翼狀胬肉、瞼球粘連、各種類型眼眶腫物摘除、孔源性視網膜脫離手術治療，以及中西醫結合治療青光眼、糖尿病性眼病、各種原因引起的網膜出血以及屈光不正，弱視等檢查治療等項目。疑難患者可以及時得到省內高級專家的會診。